Título | RELAÇÕES ENTRE A FILOGENÉTICA VIA DNA BARCODE E TRAÇOS FUNCIONAIS DE MINHOCAS NA AMAZÔNIA ORIENTAL |
Data da Defesa | 31/10/2023 |
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Banca
Examinador | Instituição | Aprovado | Tipo |
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Dr. Giovanny Angiolillo Rodriguez | UEMA | Sim | Membro | Dr. Guillaume Xavier Rousseau | UEMA | Sim | Presidente | Dr. Luis Manuel Hernández-García | UEMA | Sim | Membro | Dr. Márcio Fernandes Alves Leite | University of Ansterdam | Sim | Membro | Patrick Marie Lavelle | Université Pierre et Marie Curie | Sim | Membro |
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Palavras-Chaves | Traços Funcionais; Variabilidade dos Ecossistemas; Fatores Ambientais do Solo, Minhocas da Amazônia |
Resumo | Na ecologia das minhocas, uma questão importante é saber quais são as principais causas de
variabilidade nos traços funcionais. A alteração das condições microclimáticas, a degradação
do solo e o estresse ambiental alteram a disponibilidade de recursos e, consequentemente, as
pressões de seleção que atuam sobre os indivíduos. Este estudo procurou determinar a
importância relativa dos fatores ambientais e da taxonomia das espécies de minhocas sob a
variabilidade dos traços funcionais das espécies além de contribuir para uma melhor
compreensão do desenvolvimento dos traços funcionais (biomassa, comprimento do corpo,
diâmetro do corpo, moela, espessura da moela, espessura do septo, tiflosol, e matéria orgânica
intestinal). Coletamos amostras de minhocas de 11 espécies em diferentes regiões da Amazônia
Oriental (São Luís, Alcântara, Rosário, Centro Novo, Itinga, Tomé Açu e São José do Ribamar).
Para isso, objetivou determinar as respostas das características das diferentes espécies quando
expostas aos diferentes ecossistemas e condições do solo. Os nossos resultados sugerem que os
traços funcionais das minhocas são influenciados de formas distintas pelas condições
ambientais, sendo um conjunto de traços mais constante e independente da variabilidade
ambiental (biomassa, comprimento do corpo, diâmetro do corpo) e outro conjunto mais sensível
(diâmetro da moela, comprimento da moela, espessura do músculo da moela, espessura do
septo, tiflósole, e matéria orgânica intestinal). Investigamos também quais seriam os fatores
ambientais mais importantes para a variabilidade dos traços funcionais. No geral, o mais afetada
por diferentes variáveis ambientais foi a espessura do septo. Para o desenvolvimento da moela
e da espessura do corpo, recomendamos que a abordagem funcional seja descrita por
características morfométricos, com o menor número possível de grupos ou categorias utilizadas.
Em geral, os nossos resultados sugerem que a classificação taxonómica por si só é um bom guia
para compreender os principais traços funcionais das minhocas da Amazônia Oriental. No
segundo capítulo desta tese abordamos o uso da ferramenta molecular como Códigos de Barra
de DNA (DNA barcode) permitem delimitar grupos de espécies cuja a taxonomia é
desconhecido. O produto dos códigos de barra de DNA gera UOTM’s (Unidade Operacional
Taxônomica Molecular) que podem ser usados como morfoespécies para descrever a
diversidade e a estrutura das comunidades além de ser possível explorar as interações entre
atributos do solo e os processos ecológicos. Portanto, este estudo objetivou-se investigar o
potencial da diversidade filogenética através dos códigos de barra de DNA (DNAbarcode) com
gene COI de espécies novas de anelídeos e a sua relação com identificação mediante taxonomia
clássica. Foram processadas a extração do DNA de 1.014 amostras de minhocas. No entanto,
somente 56 amostras foram sequenciadas. Nossos resultados demonstram que apesar dos
problemas técnicos laboratoriais. Houve formação de agrupamento entre espécie de minhocas
e alguns grupos de minhocas a nível de gênero que já tiveram sido identificados pela taxonomia
clássica corroboram com análise filogenética (Pontoscolex e Andiorhinus) mediante a alta
similaridade com as bases de dados existentes. Concluímos que os dados apresentados neste
capítulo necessitam ser refeitos a partir do processo de amplificação e sequenciamento das
amostras |
Abstract | Understanding the causes of variability in functional traits is an important question in
earthworm ecology. While interspecific variation in anatomical dimensions for the same trait is
well accepted, the role of environmental filters, soil degradation, and environmental stress in
affecting the variability of functional traits is not well understood. In this study, we sought to
determine the relative importance of environmental factors and earthworm species taxonomy
on the variability in functional traits within species (intraspecific variability). We focused on
eight functional traits including body mass, body length, body diameter, gizzard, gizzard
thickness, septum thickness, typhlosole, and gut organic matter. We sampled earthworms of 11
different species in various regions of the eastern Amazon to determine the general responses
of different species` characteristics when exposed to various ecosystem and soil conditions. Our
results suggest that the functional traits of earthworms are influenced in different ways by
environmental conditions. One set of traits, including body mass, body length, and body
diameter, was more constant and independent of environmental variability, while another set,
including gizzard diameter and length, gizzard muscle thickness, septum thickness, typhlosole,
and intestinal organic matter, was more sensitive. The most affected by different environmental
variables was septum thickness. We also examined which environmental factors are most
important for trait variability. Our study highlights the importance of considering both
environmental factors and taxonomic classification when studying the variability of functional
traits within earthworm species. Overall, our results suggest that taxonomic classification alone
is a good guide for estimating the major functional traits of earthworms in the Brazilian
Amazon, but local conditions can their variability is which is essential for informing
conservation efforts and maintaining ecosystem function. In the second chapter of this thesis,
we focused on the utilization of the molecular tool known as DNA Barcodes, which enables the
identification of species groups with unknown taxonomy. The utilization of DNA Barcodes
produces UOTMs (Molecular Taxonomic Operational Units), which can serve as
morphospecies to characterize the diversity and structure of communities, as well as to
investigate the relationships between soil attributes and ecological processes. Thus, the
objective of this study was to explore the potential of DNA Barcodes in assessing
phylogenetic diversity. Specifically, we utilized the COI gene region to analyze new species of
annelids and compare their identification with classical taxonomy. We extracted DNA from a
total of 1,014 earthworm samples; however, only 56 samples were successfully sequenced.
Despite encountering technical challenges during the sample amplification and sequencing
process, our results revealed the formation of clusters among earthworm species and certain
genus-level groups, which had already been identified through classical taxonomy and were
further supported by phylogenetic analysis (e.g., Pontoscolex and Andiorhinus) due to their
significant similarity to existing databases. In conclusion, the data presented in this chapter
necessitate revisiting and repeating the amplification and sequencing procedures to ensure
accuracy and reliability. |