Corpo Discente - Egressos
Wandercleyson Uchoa Abreu
| Título | ECOVIGILÂNCIA MOLECULAR E METAGENÔMICA VIRAL EM MORCEGOS DE AMBIENTES URBANOS DA AMAZÔNIA | ||||||||||||||||||||||||
| Data da Defesa | 08/02/2023 | ||||||||||||||||||||||||
| Download | Visualizar a Tese(5.11MB) | ||||||||||||||||||||||||
Banca
| |||||||||||||||||||||||||
| Palavras-Chaves | Diversidade viral; SNG, Morcegos; Análise Filogenética. | ||||||||||||||||||||||||
| Resumo | Estudos acumulados ao longo dos últimos anos, tem mostrado que os morcegos podem abrigar vários vírus, inclusive espécies importantes que podem ser transmitidos a humanos e outros animais, e causar doença. Atualmente, o mundo sofre as consequências de um vírus, cuja origem ainda é desconhecida, porém, indícios tem reportado, como sendo um coronavírus de origem de morcegos. Assim, estudos moleculares e metagenômicos extensivos de amostras biológicas nesses animais, podem revelar um grande número de vírus, tanto aqueles já classificados como também, de vírus novos. Para elucidar a diversidade viral e as características epidemiológicas e filogenéticas, de quirópteros do Município de Santarém-Pa-Brazil, amostras de swab oral (SO), swab anal (SA), sangue (S), intestino (I), fígado (F), rins (R) e baço (B), de 5 espécies de morcegos, (Noctilio albiventris, N. leporinus, Artibeus lituratus, Myotis sp. e Molossus molossus, pertencentes a 4 Famílias (Phyllostomidae, Molossidae, Vespertilionidae e Noctilionidae), foram ao Sequenciamento de Nova Geração (SNG) na Plataforma Illumina (NovaSeq6000). Todas a atividade laboratorial foi conduzida no Laboratório de Biologia Molecular do Instituto de Medicina Tropical da Universidade de São Paulo – USP e no Centro de Estudos do Genoma Humano – Instituto de Biociências – USP. Foram analisadas 376 amostrasbiológicas (SO=56, SA=56, S=56, I=52, F=52, R=56 e B=56) divididas em pools de 5 amostras cada (total de 21 pools). O sequenciamento gerou viromas de 16 famílias – Adenoviridae, Anelloviridae, Astroviridae, Bornaviridae, Circoviridae, Coronaviridae, Genomoviridae, Hespesviridae, Parvoviridade, Papilomaviridae, Picobirnaviridae, Picornaviridae, Polyomaviridae, Paramyxoviridae, Rhabdoviridae e Retroviridae. Alguns vírus de interesse em saúde pública e veterinária e novos vírus foram confirmados nos morcegos do estudo, a partir da consulta no Banco de dados GenBank através da pesquisa de identidade em Blastn e Blastx. | ||||||||||||||||||||||||
| Abstract | Studies accumulated over the last years have shown that bats can harbor several viruses, including important species that can be transmitted to humans and other animals and cause disease. Currently, the world is suffering the consequences of a virus, whose origin is still unknown, but evidence has reported it to be a coronavirus of bat origin. Thus, extensive molecular and metagenomic studies of biological samples from these animals may reveal a large number of viruses, both classified and novel. To elucidate the viral diversity, epidemiological and phylogenetic characteristics of bats from the municipality of Santarém-PaBrazil, samples of oral swab (OS), anal swab (SA), blood (S), intestine (I), liver (R), kidneys (K) and spleen (B) from 5 bat species, (Noctilio albiventris, N. leporinus, Artibeus lituratus, Myotis sp. and Molossus molossus, belonging to 4 Families (Phyllostomidae, Molossidae, Vespertilionidae and Noctilionidae), went to Next Generation Sequencing (SNG) on the Illumina Platform (NovaSeq6000). All laboratory activity was conducted at the Laboratory of Molecular Biology of the Institute of Tropical Medicine, University of São Paulo - USP and at the Center for Human Genome Studies - Institute of Biosciences - USP. We analyzed 376 biological samples (SO=56, SA=56, S=56, I=52, F=52 and B=56) divided into pools of 5 samples each (total of 21 pools). Sequencing generated viromes from 16 Families - Adenoviridae, Anelloviridae, Astroviridae, Bornaviridae, Circoviridae, Coronaviridae, Genomoviridae, Hespesviridae, Parvoviridade, Papilomaviridae, Picobirnaviridae, Picornaviridae, Polyomaviridae, Paramyxoviridae, Rhabdoviridae and Retroviridae. Some viruses of public health and veterinary interest and new viruses have been confirmed in the study bats from the GenBank database query from Blastn and Blastx identity search. | ||||||||||||||||||||||||
Parceiros
